有研究表明，單味中藥即可有效治療球蟲病感染，如鉤藤、白頭翁、墨旱蓮、青蒿、苦楝根等均有較好療效。
其中鉤藤制劑的抗球蟲指數與地克珠利對照組的抗球蟲指數可以達到同一水平;白頭翁水提取液可以顯著減少血便堆數和卵囊數，明顯減輕盲腸病變，同時能明顯提高雞的成活率和相對增重率。
除單味中藥外，許多中藥復方制劑在治療雞球蟲病感染方面可達到高效抗球蟲藥的水平，如鉤藤復方、白頭翁苦參散、五草湯等。其中白頭翁苦參散和五草湯這兩個配方作用效果最好，0.5%的中藥制劑就能達到高效殺滅作用。
我們還可以將中西藥聯合使用或穿梭使用。中西藥聯合用藥和穿梭用藥在保證高效抗球蟲指數的前提下，可以增強中藥的藥效，且大大減少西藥的用量，防治雞球蟲病見效快，并且能防止抗藥性的產生。另外，中藥不僅具有直接的抗球蟲的作用，而且對抗雞球蟲病抗生素具有增效作用，是一種十分有應用前途的用藥方法。
雞球蟲病是一種嚴重危害養(yǎng)雞業(yè)的原蟲病，每年對我國養(yǎng)雞業(yè)都造成十分重大的損失，且目前尚未研制出有效的疫苗，治療仍依靠離子載體及化學合成藥物，目前市面上出售的大多數雞球蟲藥都有相應的抗藥株甚至交叉抗藥株出現。